發酵飼料是厭氧發酵，嚴格密封好一般是不會長菌絲的（俗稱長毛），如果有菌絲一般是進行了有氧發酵，有氧發酵相對厭氧發酵，反應會更加劇烈，因此表現會更加明顯，比如：有氧發酵會升溫或者看到有白色菌絲，這也屬于正常現象，此時，只要沒有臭味，一般對飼料品質是沒有影響的。但是，如果長時間沒有密封好，外界的雜菌就有可能進入發酵，這就可能導致飼料變壞，發酵料變壞的主要表現有：味道變臭、有灰色菌絲、綠色菌絲、黃色菌絲等。所以，發酵過程一定要嚴格密封好，減少飼料變壞概率。另外，有時候即使密封好了，也會長出白色菌絲，這也無需擔心，這是因為發酵過程沒有壓實或者容器沒有裝滿，里面有殘留的空氣導致的有氧發酵，并無害處。最后就是發酵飼料一定要選擇干凈衛生的容器，和新鮮未明顯變質的原料。這樣才能發酵出更好的飼料。